В журнале «Водные ресурсы» публикуются материалы по исследованиям водных ресурсов, режима водных объектов, гидрофизических процессов, проблем качества и охраны вод, взаимодействия вод суши с окружающей средой, по экономическим и правовым аспектам использования водных ресурсов.